工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：
至于指定基建材料、指定材料供货商，如果在合同中已经明确，也无可厚非。如果在合同中没有加以明确，施工单位又加以认可的话，也不必大惊小怪。不过，一般施工单位心中总是不是很愿意，毕竟材料占了工程预算的60％-70％，其中的利润自然可观。一个是建设单位自己采购的确可以降低成本，另一个有时施工单位采购的材料的确不过关，如果在合同中没有对于品牌、型号、材质加以明确的话，施工单位采购进来的材料一般都不是很好的。建设单位对这方面加以控制的话也可以理解。因为结算时一般以信息价和市场价调整，而信息价的利润幅度还是又的，市场价又难以把握，就象该文作者自己说的那样，所以建设单位此举说是控制成本也可以理解。作者把这些都看成时不正常的举动，未免太偏颇了。
工程预算工作内容：
1.认真对照商务标清单，把全部清单工程量全部自己计算一遍，看看是否有误差
2.认真对照商务标清单，把清单综合单价和主材价与市场询价做好对比，然后分析
3.进行分包时，要做法严格控制分包单位的清单工程量及价格
4.积极到现场去观察，做好图纸会审的工作，提出有利我方的变更签证
5.相关工程进度款格式、月报格式、工程联系单格式、现场经济签证格式等要从监理及甲方要取。
6.工程联系单、现场经济签证单及索赔的编制切记要理由充分，论点鲜明，证据齐全，把原因全归结于甲方、监理、设计院及其它因素，加大事情严重性及我方损失性，工程量适当加大。
单位工程预算的编制依据
(1)上级领导机关对该单位工程的要求、建设单位的意图和要求、工程承包合同、施工图对施工的要求等；
(2)施工组织总设计和施工图；
(3)年度施工计划对该工程的安排和规定的各项指标；
(4)预算文件提供的有关数据；施工技术资料目录：⑴总目录；⑵工程建设前期法定建设程序文件；⑶建筑工程综合管理资料；⑷地基与基础工程⑸主体结构工程；⑹建筑装饰装修工程；⑺建筑屋面工程；⑻建筑设备安装工程综合管理资料；⑼建筑给水、排水及采暖工程；